Evolución de la COVID-19 en España
Última actualización realizada: 13 junio 2022
El profesor
Carlos Fernández Lozano
de la
Universidade da Coruña
e investigador del Centro de Investigación en Tecnologías de la Información y las Comunicaciones
(CITIC)
, puso en marcha un dashboard de
Shiny
y
R
que permite monitorizar la evolución de la Covid-19 en España. La idea surgió a partir del trabajo realizado por el investigador
Rubén Fernández Casal
, que comenzó a capturar los datos del Ministerio de Sanidad,
Consumo y Bienestar del Gobierno de España relativos a los contagios por la Covid-19. Esta iniciativa colaborativa cuenta con el respaldo del comité de expertos de la 'Acción Matemática contra el Coronavirus' del
Comité Español de Matemáticas (CEMat), a través de su presidente
Ricardo Cao
, también investigador del
CITIC
, que tiene el objetivo de ayudar al Gobierno a encontrar soluciones ante la crisis sanitaria.
El dashboard de shiny permite consultar los datos relativos al número de casos confirmados afectados por la Covid-19 por comunidades autónomas en las últimas semanas, así como los pacientes hospitalizados, ingresados en la UCI,
incidencia acumulada (14 días) y los fallecimientos, además de ofrecer una foto actualizada del proceso de vacunación y la evolución de los reportes de datos. Muestra también la pirámide de población separada por edad y sexo para los casos, fallecimientos, hospitalizados e ingresos en la UCI por la Covid-19. Además, da soporte
a los resultados obtenidos por los múltiples grupos de investigación participantes de la 'Acción Matemática contra el Coronavirus' y muestra informes dinámicos resumen. Está desarrollada con
Shiny
y
R
.
Las herramientas y los datos que he usado son abiertos y por tanto, en el desarrollo he seguido los principios de acceso abierto del
ERC
. A partir de la fuente original los datos son pre-procesados y se añade información complementaria
como apoyo de la representación gráfica utilizada (coordenadas de latitud y longitud, población, generación de variables con cantidades acumuladas, incidencia acumulada, etc). Los he dejado disponibles para descarga en forma de csv en la propia web,
puedes disponer de ellos ;)
Este sitio se actualiza, al menos, una vez al día de forma automática al detectar la publicación de la serie histórica de seguimiento de la covid-19 del ISCIII
https://cnecovid.isciii.es/covid19/
.
El desarrollo de esta página y de la aplicación
forecoop.citic.udc.es
han sido posibles gracias al fondo SUPERA COVID 19, promovido por CRUE Universidades Españolas, el el Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) y Banco Santander.
Equipo técnico de apoyo
Código
El código y los datos necesarios para generar el dashboard Shiny de R estarán disponibles en breve en
Github.
Esta aplicación contiene código adaptado de las siguientes fuentes:
Ejemplo de Shiny en
GitHub
Ejemplo de Shiny en
GitHub
Ejemplo de Shiny en
Rstudio
Ejemplo de Shiny en
GitHub
Fuentes de datos:
Casos COVID-2019 en España: página web del Dr. Rubén Fernández Casal en
GitHub
Fuente original: Ministerio de Sanidad, Consumo y Bienestar Social. NOTA: Los datos de la fuente original van cambiando continuamente de formato :(
Coordenadas para mapear los países:
Github
Coordenadas para mapear las comunidades autónomas: Wiki de openStreetMap
enlace
Datos de población por comunidades autónomas:
Instituto Nacional de Estadística
Actualmente la web se alimenta directamente de los datos de
Situación de COVID-19 en España
publicados por el
Instituto de Salud Carlos III. (ISCIII)
Autor
Dr Carlos Fernandez-Lozano
Departmento de Computación e Inteligencia Articial de la Universidad de la Coruña (UDC)
Centro de Investigación en Tecnologías de la Información y las Comunicaciones (CITIC)
Contacto
carlos.fernandez@udc.es